Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1cQ76I25 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms