Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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