Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms