Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp8b3Q6UQ17 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp8b3Q6UQ17 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp8b3Q6UQ17 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp8b3Q6UQ17 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp8b3Q6UQ17 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp8b3Q6UQ17 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp8b3Q6UQ17 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp8b3Q6UQ17 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp8b3Q6UQ17 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp8b3Q6UQ17 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Atp8b3Q6UQ17 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Atp8b3Q6UQ17 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Atp8b3Q6UQ17 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp8b3Q6UQ17 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp8b3Q6UQ17 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b3Q6UQ17 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b3Q6UQ17 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b3Q6UQ17 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b3Q6UQ17 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b3Q6UQ17 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b3Q6UQ17 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b3Q6UQ17 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b3Q6UQ17 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b3Q6UQ17 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b3Q6UQ17 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b3Q6UQ17 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b3Q6UQ17 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b3Q6UQ17 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b3Q6UQ17 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b3Q6UQ17 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b3Q6UQ17 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b3Q6UQ17 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp8b3Q6UQ17 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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