Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nup98Q6PFD9 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup98Q6PFD9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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