Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms