Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Atg9bQ6EBV9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Atg9bQ6EBV9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Atg9bQ6EBV9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg9bQ6EBV9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Atg9bQ6EBV9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9bQ6EBV9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9bQ6EBV9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9bQ6EBV9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9bQ6EBV9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9bQ6EBV9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9bQ6EBV9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9bQ6EBV9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9bQ6EBV9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9bQ6EBV9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9bQ6EBV9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9bQ6EBV9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9bQ6EBV9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9bQ6EBV9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9bQ6EBV9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9bQ6EBV9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9bQ6EBV9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9bQ6EBV9 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9bQ6EBV9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg9bQ6EBV9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms