Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pram1Q6BCL1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pram1Q6BCL1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pram1Q6BCL1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pram1Q6BCL1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pram1Q6BCL1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pram1Q6BCL1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pram1Q6BCL1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pram1Q6BCL1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pram1Q6BCL1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pram1Q6BCL1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pram1Q6BCL1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pram1Q6BCL1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms