Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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AtmQ62388 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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AtmQ62388 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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AtmQ62388 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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AtmQ62388 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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AtmQ62388 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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AtmQ62388 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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AtmQ62388 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtmQ62388 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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