Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm5dQ62240 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm5dQ62240 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm5dQ62240 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm5dQ62240 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5dQ62240 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5dQ62240 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5dQ62240 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5dQ62240 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5dQ62240 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5dQ62240 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5dQ62240 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5dQ62240 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5dQ62240 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5dQ62240 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5dQ62240 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5dQ62240 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5dQ62240 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5dQ62240 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5dQ62240 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5dQ62240 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5dQ62240 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms