Protein–RNA interactions for Protein: Q62170

Selplg, P-selectin glycoprotein ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelplgQ62170 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelplgQ62170 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms