Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cd47Q61735 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cd47Q61735 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cd47Q61735 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cd47Q61735 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cd47Q61735 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cd47Q61735 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd47Q61735 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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