Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms