Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms