Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms