Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim58Q5NCC9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim58Q5NCC9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim58Q5NCC9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trim58Q5NCC9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim58Q5NCC9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trim58Q5NCC9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trim58Q5NCC9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim58Q5NCC9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim58Q5NCC9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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