Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms