Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spire1Q52KF3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spire1Q52KF3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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