Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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