Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms