Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms