Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms