Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Ulk4Q3V129 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ulk4Q3V129 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ulk4Q3V129 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ulk4Q3V129 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ulk4Q3V129 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ulk4Q3V129 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ulk4Q3V129 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk4Q3V129 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms