Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms