Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms