Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9Q3V038 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms