Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fchsd2Q3USJ8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fchsd2Q3USJ8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fchsd2Q3USJ8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fchsd2Q3USJ8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fchsd2Q3USJ8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fchsd2Q3USJ8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fchsd2Q3USJ8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fchsd2Q3USJ8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fchsd2Q3USJ8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fchsd2Q3USJ8 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fchsd2Q3USJ8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fchsd2Q3USJ8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fchsd2Q3USJ8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fchsd2Q3USJ8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fchsd2Q3USJ8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms