Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec31aQ3UPL0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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