Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp30Q3UN04 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp30Q3UN04 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp30Q3UN04 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Usp30Q3UN04 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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Usp30Q3UN04 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Usp30Q3UN04 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Usp30Q3UN04 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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