Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpr55Q3UJF0 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpr55Q3UJF0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpr55Q3UJF0 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpr55Q3UJF0 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpr55Q3UJF0 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpr55Q3UJF0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpr55Q3UJF0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpr55Q3UJF0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpr55Q3UJF0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpr55Q3UJF0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpr55Q3UJF0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpr55Q3UJF0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpr55Q3UJF0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpr55Q3UJF0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpr55Q3UJF0 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms