Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms