Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm648Q3UJ22 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm648Q3UJ22 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm648Q3UJ22 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm648Q3UJ22 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Gm648Q3UJ22 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm648Q3UJ22 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm648Q3UJ22 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm648Q3UJ22 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm648Q3UJ22 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm648Q3UJ22 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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