Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms