Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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