Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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