Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms