Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms