Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms