Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms