Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLH4

Prrc2c, Protein PRRC2C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2cQ3TLH4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrc2cQ3TLH4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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