Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Prr27Q3SYJ2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Prr27Q3SYJ2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Prr27Q3SYJ2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Prr27Q3SYJ2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Prr27Q3SYJ2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Prr27Q3SYJ2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Prr27Q3SYJ2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Prr27Q3SYJ2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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