Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms