Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms