Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rpusd2Q149F1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rpusd2Q149F1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rpusd2Q149F1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rpusd2Q149F1 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rpusd2Q149F1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rpusd2Q149F1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rpusd2Q149F1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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