Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
StumQ0VBF8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms