Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms