Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms