Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC8.77□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Plac8l1Q08EJ0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Plac8l1Q08EJ0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms