Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SctQ08535 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SctQ08535 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SctQ08535 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SctQ08535 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SctQ08535 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SctQ08535 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SctQ08535 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SctQ08535 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SctQ08535 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SctQ08535 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SctQ08535 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SctQ08535 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SctQ08535 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SctQ08535 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SctQ08535 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SctQ08535 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SctQ08535 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SctQ08535 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SctQ08535 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SctQ08535 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SctQ08535 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SctQ08535 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SctQ08535 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SctQ08535 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SctQ08535 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SctQ08535 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SctQ08535 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SctQ08535 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SctQ08535 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SctQ08535 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SctQ08535 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SctQ08535 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SctQ08535 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SctQ08535 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SctQ08535 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms