Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms